El Monasterio posee una abundante decoración y unos reconocidos espacios como la igleisa, la sacristía – de autor desconocido – y el sagrario, una obra realizada por Francisco Hurtao Izquierdo.

La Cartuja goza de una maravillosa y magnífica cúpula pintada, obra llevada a cabo por Antonio Palomino, en ella tambien yace importantes pinturas destacando las del cartujo Juan Sánchez Cotán.